胚胎干細胞具有分化成為各種成熟體細胞的能力，這種特性使胚胎干細胞無論在基礎研究還是在臨床應用上，都具有非常重要的價值。深入解析胚胎干細胞的自我更新和分化機制，一直是科學家們關注的焦點之一。

包括組蛋白修飾在內的表觀遺傳學修飾，能在不改變DNA序列的情況下影響基因的表達。根據修飾位點以及修飾狀態的不同，組蛋白甲基化能夠激活或抑制基因轉錄，進而調控胚胎干細胞定向分化等正常生理過程。

研究人員發現，Setd2主要調控鼠類胚胎干細胞（mESC）向原始內胚層分化。進一步研究顯示，在Setd2−/− mESC中下調的內胚層相關基因，與Erk異常低的活性水平有關。而增強Fgfr3的表達，能夠挽救Setd2−/− mESC中有缺陷的Erk通路。

有趣的是，研究人員發現Fgfr3的轉錄起始受到Setd2甲基化的直接調控。Setd2能夠對Fgfr3的遠端啟動子區域進行組蛋白H3K36me3修飾。這些結果表明，Setd2通過調控Fgfr3-Erk信號通路，控制著mESC分化成為原始內胚層。