所謂滅菌就是殺死一切微生物，由于培養基里的營養豐富，因此會有許多菌落在上面生長，會直接導致實驗的失敗，包括微生物的營養體和芽孢，這一概念不同于消毒。后者是指消滅一切致病微生物（病原體）。

    培養基為什么要滅菌呢？主要有以下幾點原因：如不滅菌雜菌會產生代謝產物，這就使產物的提取更加困難，造成得率降低，產品質量下降；有些雜菌會分解產物，使實驗失敗；雜菌大量繁殖后，會改變反應液的pH值，使反應異常；如果發生噬菌體污染，生產菌細胞將被裂解，會直接導致實驗的失敗。