蛋白marker的作用是什么，先要要了解一下什么是蛋白marker。在Western Blot過程中，分子量Marker就像個螺絲釘一樣沒雖然是個小細節，然而就是這樣一個小細節對實驗結果有著不可忽視的作用。
      蛋白marker的作用：
      Marker是表面覆蓋有特殊反光材料的標記物，常見形狀有球形、半球形。染色體上一個可以被識別的區域（比如限制性內切酶的酶切點，基因的位置等）。標記的遺傳能夠被檢測出來。標記可以是染色體上有表達功能的部分（比如基因），也可以是沒有編碼蛋白質功能但遺傳特性能夠被檢測出來的部分。其次，蛋白marker可分為未預染的Marker即寬分子量蛋白標準、高分子量蛋白標準以及低分子量蛋白標準以及預染的Marker即單色預染和多色預染。
      預染蛋白分子量標準
      預染蛋白分子量是一些純化好的蛋白混合物，通過與染料共價耦聯，在電泳過程中或者轉膜時可以直接觀察到。預染蛋白分子量的出現方便了我們的實驗，這種蛋白分子量標準可以幫助我們在電泳時、電泳后，以及轉膜后監測電泳情況和估計遷移率。值得注意的是預染蛋白Marker與染料共價耦聯，所以在不同的緩沖條件下電泳時遷移特性可能會發生某些變化，可能導致一些偏差，所以不太適合定位蛋白——不過多數情況下Marker的條帶未必能和我們的目標蛋白*一樣，我們得到的也不過是一種相對Marker指示的參考大小，后都需要Western來定性，所以如果不是要區分大小相近的條帶，預染Marker還是很好用的，而且也可以和未染色的蛋白標準一起使用。
      蛋白分子量標準可以分成未染蛋白分子量標準、預染蛋白分子量標準二個。蛋白標準還有表示轉移成功或者蛋白在凝膠上的電泳程度等等的作用，所以選擇正確的蛋白Marker也是western blot實驗成功的必要條件之一。以上就是今天要介紹的蛋白marker的作用。